Как наложить одно изображение на другое в opencv 3?

Если я вас правильно понял, та вам нужна функция blendLinear. Для ее использования придется немножко повозиться, так как она принимает 5 аргументов:

• первое трехканальное изображение
• второе трехканальное
• альфа (чаще всего требуется 1 - beta)
• бета (четвертый канал второго изображения)
• выходное изображение

При этом альфа и бета - однокональные и имеют тип CV_32F. Если вам нужен ещё и четвертый канал (выходной), то это вычисляется отдельно по формуле:

beta + alpha(1 - beta)