Как правильно считывать в структуру?

Примерно так - кстати, первой строчки в ваших данных нет:

#include <vector>
#include <string>
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <iomanip>
using namespace std;
#pragma pack(push, 1)
struct structEx
{
    int a;
    float b;
};
#pragma pack(pop)
vector<structEx> v;
int main(int argc, const char * argv[])
{
    ifstream in("data");
    string s;
    while(getline(in,s))
    {
        structEx x;
        unsigned char * a = reinterpret_cast<unsigned char *>(&x);
        for(int i = 0; i < 8; ++i)
            *(a+i) = stoi(s.substr(i*2,2),nullptr,16);
        v.push_back(x);
    }
    for(auto x: v)
    {
        cout << setw(10) << x.a << setw(20) << x.b << endl;
    }
}