Получить ID потока в переменную

Тип ID потока свободен и может быть исполнен в любом исполнении разными компиляторами. Можно нарисовать как список байтов так :

// g++ -Wall -Wpedantic showthrid.cpp
# include <iostream>
typedef
union {
  volatile pthread_t tid;
  volatile uint8_t bid [sizeof(pthread_t)];
  }
uid ;
int main(){
    uid u ;
    u.tid = pthread_self();
    std::cout<<"pthread_self = "<<std::hex;
    for(int i=sizeof(pthread_t);i;){
        -- i ;
        std::cout<<((unsigned int )u.bid[i])<<".";
        }
    std::cout<<std::endl;
    std::cout<<" = "<<((size_t)u.tid)<<std::endl; }
$ ./a.out 
pthread_self = 0.0.7f.3b.21.d0.4d.80.
 = 7f3b21d04d80

И если вы найдёте численный тип с нужным размером, то на этот тип и кидайте значение. У меня размер 8 байт. То есть можно впихнуть в size_t.

pthread_self возвращает дескриптор потока, не особо пригодный для печати и чтения. Получить числовой идентификатор потока можно так:

#ifndef _GNU_SOURCE
#define _GNU_SOURCE
#endif
#include <unistd.h>
#include <sys/syscall.h>
#include <errno.h>
#include <stdlib.h>
#include <stdio.h>
int main()
{
    long id;
    errno = 0;
    id = syscall(SYS_gettid);
    if(0 != errno)
    {
        perror("syscall(SYS_gettid) failed");
        abort();
    }
    fprintf(stdout, "thread id %li", id);
    return 0;
}