При работе с файлами после каждой строки вставляются буквы М

Как минимум - у вас строка str[i] рассчитана на 25 символов, а вы готовы читать 300: fgets(str[i], 300, in);...

И какой смысл в цикле

for (int j = 0; j < 1; j++)

??

А тут -

printf("%c",str[i][j]);

вы выводите все, весь мусор! а не останавливаетесь по достижении завершающего нулевого символа...

Вобщем, попробуйте так:

char str[10][300];
FILE * in=fopen("file.txt", "rt");
for (int i = 0; i < 10; i++)
{
    fgets(str[i], 300, in);
}
for (int i = 0; i < 10; i++)
{
    printf("%s",str[i]);
}
system("pause");
return 0;