c# List<T>, получить item не по индексу,а по значению

public class SectionClass
{
  public string Name {get;set;}
  public string Comment {get; set; }
 ...
 public string Value {get;set;} 
}

SectionClass section = MyList[2]

SectionClass section = MyList["Секция 1"]

Если речь идет о самописной коллекции, то вы можете объявить свой индексатор, а за "кулисами" делать все, что душе угодно, например видимость того, что массив индексируется не с 0, а с 1, а можете как вы хотите сделать индексацию по строке.

Например, так:

public class Reports
{
    System.Collections.Generic.IDictionary<string,string> queries;
    public string this[string key]
    {
        get
        {
            return this.queries[key];
        }
    }
}

Никак, List<T> предоставляет к элементам доступ только по индексу.

Если нужен доступ по какому-то ключу, стоит вместо списка использовать Dictionary<TKey,TValue>

Либо воспользоваться поиском, например с помощью метода Find

Либо с помощью Linq, например метод First

Dictionary<string, SectionClass> MyList = Dictionary<string, SectionClass>();