не работает прокрутка в ListBox из-за DataGrid

Ваша проблема решается следующим образом:

1) Вам не нужно вручную добавлять каждый раз элемент ListBoxItem в ListBox, для того что бы отобразить в нем элемент DataGrid. Для этого достаточно определить ItemTemplate.

<ListBox>
    <ListBox.ItemTemplate>
        <DataTemplate>
            <GroupBox>
                <DataGrid>
                    <DataGrid.Columns>                  
                        <DataGridTextColumn />
                        <DataGridTextColumn />
                    </DataGrid.Columns>
                </DataGrid>
            </GroupBox>
        </DataTemplate>
    </ListBox.ItemTemplate>
</ListBox>

2) Затем на понадобиться Behavior, который будет пробрасывать событие MouseWheel, для того что бы работала прокрутка в DataGrid.

public class MouseWheelBehavior : Behavior<UIElement>
{
    protected override void OnAttached()
    {
        base.OnAttached();
        AssociatedObject.PreviewMouseWheel += OnPreviewMouseWheel;
    }
    protected override void OnDetaching()
    {
        AssociatedObject.PreviewMouseWheel -= OnPreviewMouseWheel;
        base.OnDetaching();
    }
    private void OnPreviewMouseWheel(object sender, MouseWheelEventArgs e)
    {
        e.Handled = true;
        var args = new MouseWheelEventArgs(e.MouseDevice, e.Timestamp, e.Delta);
        args.RoutedEvent = UIElement.MouseWheelEvent;
        AssociatedObject.RaiseEvent(args);
    }
}

3) Далее добавляем созданный Behavior к DataGrid.

<ListBox>
    <ListBox.ItemTemplate>
        <DataTemplate>
            <GroupBox>
                <DataGrid>
                    <DataGrid.Columns>                  
                        <DataGridTextColumn />
                        <DataGridTextColumn />
                    </DataGrid.Columns>
                    <i:Interaction.Behaviors>
                        <wpfApplication1:MouseWheelBehavior />
                    </i:Interaction.Behaviors>
                </DataGrid>
            </GroupBox>
        </DataTemplate>
    </ListBox.ItemTemplate>
</ListBox>

4) Создаем модели, которые будем отображать в нашем списке. В простейшем виде, они могут выглядеть так:

public class Customer
{
    public string Name { get; set; }
    public int Age { get; set; }
}
public class Item
{
    public List<Customer> Customers { get; }
    public string TableName { get; set; }
    public Item()
    {
        Customers = new List<Customer>();
    }
}

5) Итоговая разметка:

<Window x:Class="WpfApplication1.MainWindow"
        xmlns="http://schemas.microsoft.com/winfx/2006/xaml/presentation"
        xmlns:x="http://schemas.microsoft.com/winfx/2006/xaml"
        xmlns:i="http://schemas.microsoft.com/expression/2010/interactivity"
        xmlns:viewModel="clr-namespace:WpfApplication1.ViewModel"
        xmlns:wpfApplication1="clr-namespace:WpfApplication1">
    <Grid>
        <ListBox HorizontalContentAlignment="Stretch"
                 ItemsSource="{Binding Items}"
                 ScrollViewer.CanContentScroll="False"
                 ScrollViewer.HorizontalScrollBarVisibility="Disabled">
            <ListBox.ItemTemplate>
                <DataTemplate>
                    <GroupBox Header="{Binding TableName}">
                        <DataGrid AutoGenerateColumns="False" ItemsSource="{Binding Customers}">
                            <DataGrid.Columns>
                                <DataGridTextColumn Width="*" Binding="{Binding Name}" Header="Имя" />
                                <DataGridTextColumn Width="100" Binding="{Binding Age}" Header="Возраст" />
                            </DataGrid.Columns>
                            <i:Interaction.Behaviors>
                                <wpfApplication1:MouseWheelBehavior />
                            </i:Interaction.Behaviors>
                        </DataGrid>
                    </GroupBox>
                </DataTemplate>
            </ListBox.ItemTemplate>
        </ListBox>
    </Grid>
</Window>

6) Во viewModel заполняем тестовыми данными нашу коллекцию.

public class MainViewModel : ViewModelBase
{
    public ObservableCollection<Item> Items { get; }
    public MainViewModel()
    {
        Items = new ObservableCollection<Item>();
        for (int i = 0; i < 100; i++)
        {
            var item = new Item()
            {
                TableName = $"Таблица {i + 1}"
            };
            for (int j = 0; j < 500; j++)
            {
                item.Customers.Add(new Customer()
                {
                    Name = $"Имя {j + 1}",
                    Age = j + 5
                });
            }
            Items.Add(item);
        }
    }
}

Оберните ListBox в

<ScrollViewer x:Name="MyScrollViewer" >

Добавьте в ListBox событие

PreviewMouseWheel="grid_MouseWheel"

Обработайте событие:

private void grid_MouseWheel(object sender, MouseWheelEventArgs e)
{
    if (e.Delta < 0) MyScrollViewer.LineDown(); else MyScrollViewer.LineUp();
}