Проверка всех CheckBox в C#

Ну раз это все же WinForms, то банально взять все контролы одного типа:

var checkBoxes = Controls.OfType<CheckBox>();

Где Controls - свойство самой формы. OfType - LINQ фильтрация коллекции по типу.

Результатом будет коллекция, которая содержит в себе все CheckBox текущего окна. А дальше делайте что вашей душе угодно, хоть циклом гоняйте, хоть меняйте значения определенным элементам.

Для WinForms

List<CheckBox> allBoxes = new List<CheckBox>();
foreach(var checkBox in this.Controls){
    if (checkBox is CheckBox)
        allBoxes.Add(checkBox);
    //Или работать вот тут со свойством Checked
}

Для WPF

foreach( FrameworkElement checkBox in grid.Children )
{
   if (checkBox is CheckBox)
   {
       //Опять работаем с каждым. Можно сначала в массив, а потом по индексу
   }
}