Вертикально объединить два изображения с разными размерами C#

С указанной Вами библиотекой я не имею чести быть знакомым, так что привожу простенькое решение, исходя из стандартных инструментов

В Вашем коде нигде и не указано масштабирование изображений, а метод Graphics.DrawImage, который Вы применяли,

рисует заданную часть указанного объекта Image в заданном месте, используя заданный размер.

Так что ничего удивительного в том, что изображения обрезались, нет)

Для того, чтобы изображение было отмасштабировано, а не обрезано, Вам следует использовать конструктор Bitmap(Image, Size), который

инициализирует новый экземпляр Bitmap из указанного существующего изображения, масштабированного до заданного размера.

Итак, привожу решение с комментариями:

public static Bitmap MergeTwoImages(Image firstImage, Image secondImage)
{
    // Проверяем, меньше ли ширина первого изображения, чем второго 
    // (Попутно проверяем на null)
    if ((firstImage ?? throw new ArgumentNullException("firstImage")).Width < (secondImage ?? throw new ArgumentNullException("secondImage")).Width)
        // Масштабируем второе изображение
        secondImage = ResizeImgByWidth(secondImage, firstImage.Width);
    else
        // Эта проверка на случай равенства ширины изображений
        if (firstImage.Width > secondImage.Width)
            // Масштабируем первое изображение
            firstImage = ResizeImgByWidth(firstImage, secondImage.Width);
    // Создаем Bitmap с шириной картинок (на данном шаге они уже точно равны) и их суммарной высотой
    Bitmap result = new Bitmap(firstImage.Width, firstImage.Height + secondImage.Height);
    // Создаем Graphics из заданного изображения
    using (Graphics g = Graphics.FromImage(result))
    {
        // Отрисовываем первую картинку в верхнем левом углу
        g.DrawImage(firstImage, new Point(0, 0));
        // Отрисовываем вторую картинку под первой
        g.DrawImage(secondImage, new Point(0, firstImage.Height));
    }
    return result;
}
// Пропорционально изменяем размер изображения по указанной ширине
private static Bitmap ResizeImgByWidth(Image Img, int NewWidth) => new Bitmap(Img, new Size(NewWidth, (int)(Img.Height * (NewWidth / (double)Img.Width))));

Проверим:

MergeTwoImages(Image.FromFile("test0.png"), Image.FromFile("test1.png")).Save("done.png");

И получим на выходе такое изображение
(чтобы не засорять пост, привожу только результат, разные картинки в нем видны явно):

Собственно, я не удержался от того, чтобы сделать решение адаптивным для любого числа изображений на входе)

Получилось так:

public static Bitmap MergeImages(params Image[] Images)
{
    // Проверка на пустоту упакованного массива
    if (Images == null || Images.Length == 0)
        throw new ArgumentException("`Images` can't be empty!", "Images");
    // Получаем минимальную ширину, на которую позже будем ориентироваться
    // (Попутно проверяем изображения на null)
    int minWidth = Images.OrderBy(x => (x ?? throw new NullReferenceException()).Width).First().Width;
    // Получаем коллекцию отмасштабированных изображений
    IEnumerable<Image> resized = Images.Select(x => x.Width > minWidth ? ResizeImgByWidth(x, minWidth) : x);
    // Создаем Bitmap с минимальной шириной и суммарной высотой результирующих картинок
    Bitmap result = new Bitmap(minWidth, resized.Sum(x => x.Height));
    // Создаем Graphics из заданного изображения
    using (Graphics g = Graphics.FromImage(result))
    {
        int currentHeight = 0;
        foreach (Image img in resized)
        {
            // Отрисовываем текущую картинку, увеличивая шаг на ее высоту
            g.DrawImage(img, new Point(0, currentHeight));
            currentHeight += img.Height;
        }
    }
    return result;
}
// Пропорционально изменяем размер изображения по указанной ширине
private static Bitmap ResizeImgByWidth(Image Img, int NewWidth) => new Bitmap(Img, new Size(NewWidth, (int)(Img.Height * (NewWidth / (double)Img.Width))));

Проверим:

MergeImages(Image.FromFile("test0.png"), Image.FromFile("test1.png"), Image.FromFile("test2.png")).Save("done.png");

Результат:

Надеюсь, мой ответ смог Вам помочь!
Удачи в Ваших делах)