Автоприращивание MySQL не с единицы, а с длинного числа

Никак, и незачем. Если для красоты представления, типа example.com/index.php?id=00000001 или в тексте "ваш id=00000001" вместо "ваш id=1", то конкатенировать (при отображении) и отрезать (при обращении к базе) нужное количество нулей в строке средствами PHP, но в базе оно все равно будет 1, 2, 3,...,n.

В базе такое не храниться. Для клиентской части подойдет str_pad - вы сможете дописать спереди столько нулей, сколько нужно. А если их надо убрать - str_replace

$input = str_pad($input, 8, "0", STR_PAD_LEFT);
$input = str_replace("0", "", $input);

Вот так можно при создании таблицы начать с 1000000 :

CREATE TABLE demo (
  id int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
  color varchar(50) DEFAULT NULL COMMENT 'Название цвета',
  PRIMARY KEY (id)
)
ENGINE = INNODB
AUTO_INCREMENT = 1000000 --Начинаем с 1000000
AVG_ROW_LENGTH = 4096
CHARACTER SET utf8
COLLATE utf8_general_ci
ROW_FORMAT = DYNAMIC;

А вот так изменить таблицу:

ALTER TABLE demo AUTO_INCREMENT=1000000 

И вот так можно отобразить! '00000000001' :

SELECT LPAD(id, 11, 0) AS id, color FROM demo;