Игнорировать null при десериализации JSON

Если вы используете Spring boot, тогда это можно настроить в application.properties.

spring.jackson.deserialization.fail-on-unknown-properties=false

Если у вас не spring boot приложение, тогда надо сделать бин со следующими настройками:

@Bean
ObjectMapper objectMapper() {
            return Jackson2ObjectMapperBuilder.json()
            .failOnUnknownProperties(false)
            .build();
}

Добавь свой десериалайзер

public final class JsonWithNullDeserializer
    extends JsonNodeDeserializer
{
    @Override
    public JsonNode getNullValue(DeserializationContext ctxt)
    {
        return null;
    }
}

И задай этот десериалайзер везде где нужно

@JsonDeserialize(using = JsonWithNullDeserializer.class)