Изменения внесённые на одной из веток проекта сразу переносятся на все другие ветки

При работе с проектом в intellij idea, после внесения каких либо изменений (изменение текста кода или создание файла) эти изменения сразу передаются и на другие ветки. Если удалить их (эти изменения) на любой из веток, они так же удалятся отовсюду. Раньше такого не было и изменения добавленные на ветке только там и хранились, в чём может быть проблема?