Java getResource() поиск ресурса при наличии JavaAgent

Проблема появляется если приложение и агент находятся в одном JAR файле и приложение запускается так : java -javaagent:App.jar myapp.Main
Для исправления нужна такая строка запуска: java -javaagent:App.jar -cp App.jar myapp.Main

Я делаю так:

import org.apache.commons.io.IOUtils;
IOUtils.toString(MyClass.class.getResourceAsStream("file.txt"));

file.txt должен лежать в папке web-app/resources в том же пакете что и MyClass.