Java слияние двух объектов (Json, ObjectMapper)

Думаю можно попробовать использовать метод putAll класса JSONObject из библиотеки json-simple например:

import org.json.simple.JSONObject;
public class Test {
    public static void main(String[] args) {
        JSONObject jsonObj = new JSONObject();
        jsonObj.put("nat_udp_update_time", 15);
        jsonObj.put("static_sip_local_port", 1111);
        JSONObject jsonObj2 = new JSONObject();
        jsonObj2.put("nat_udp_update_time", 333);
        jsonObj.putAll(jsonObj2);
        System.out.println(jsonObj);
    }
}

Вывод:

{"static_sip_local_port":1111,"nat_udp_update_time":333}

Надеюсь то, что надо.