Как использовать переменную из метода в главном методе java?

Тут два варианта : вынести переменную как поле класса (например private int a) или передать ее через параметр метода, т.е. поменять немного сигнатуру метода. Также, у Вас есть распространенная ошибка, у Вас в проверке = вместо == (= - это оператор присваивания, а == - оператор сравнения). Поправьте меня, если я неправильно понял вопрос

Так будет проще всего:

public class Battleship {
    public static void main(String[] args) {
        int dir = choice_dir();
        if (dir == 1) {
            //doSomethig...
        }
    }
    int choice_dir() {
        int rm_min = 1;
        int rm_max = 2;
        return rm_min + (int) (Math.random() * rm_max);
    }
}

Как указывал @Ladence в dir = 1 = нужно заменить на ==.