Как изменить цвет во всех классах которые указаны в JCheckBox

Во всех классах с помощью одного класса? Что? Вы это имеете в виду?

JCheckBox jCheckBox = new JCheckBox();
jCheckBox.addActionListener(e -> {
    if(jCheckBox.isSelected()) jCheckBox.setBackground(Color.RED);
    else jCheckBox.setBackground(Color.BLUE);
});

Создайте собственный класс MyJCheckBox, и в его конструкторе пропишите добавление слушателя:

class MyJCheckBox extends JCheckBox {
    public MyJCheckBox() {
        addActionListener(e -> {
            if(isSelected()) setBackground(Color.RED);
            else setBackground(Color.BLUE);
        });
    }
}