Как отследить переключение RadioButton?

Когда вы создаёте программно RadioButton, вы можете задать ему id. Можно, к примеру, записывать созданные кнопки в

ArrayList<RadioButton> list;

Тогда id кнопке можно задавать как размер списка:

RadioButton radioButton = new RadioButton(this);
// Задаём id
radioButton.setId(list.size());
list.add(radioButton);
radioGroup.addView(radioButton);

В onCreate задаём RadioGroup слушателя:

list = new ArrayList<RadioButton>();
radioGroup = (RadioGroup) findViewById(R.id.radioGroup);
radioGroup.setOnCheckedChangeListener(new RadioGroup.OnCheckedChangeListener() {
        @Override
        public void onCheckedChanged(RadioGroup group, int checkedId) {
            //checkedId - индекс кнопки в ArrayList
            RadioButton button = list.get(checkedId);
        }
    });

Уже в слушателе, зная id, можно обратиться к самой кнопке.