Есть JSP-файл с описанием HTML, в нем есть js-скрипты: ajax и все такое.
Что лучше оставить их там или создать для них js-файл и обращатся так?
Js лучше хранить отдельно (как картинки и стили). Если объем у js большой (и файлов много), то лучше его минифицировать и объединить в один js.
Сборка персонального компьютера от Artline: умный выбор для современных пользователей