Как проверить ввод пользователя по всем регистрам?

Console.Write("Выйти?(y/n): ");
string quit = Console.ReadLine().ToLower();
if (quit == "y") {
   break;
}
else {
   // Continue
}

https://ideone.com/5l3tzX

import java.io.*;
class Ideone {
  public static void main (String[] args) throws Exception {
    BufferedReader in = new BufferedReader(new InputStreamReader(System.in));
    if (in.readLine().trim().toLowerCase().equals("y")) {
      System.out.println("It was YES");
    }
  }
}

import java.util.Scanner;
System.out.print("Выйти?(y/n): ");
Scanner in = new Scanner(System.in);
String quit = in.nextLine();
String toLowerQuit = quit.toLowerCase();

В Java у объекта типа String есть фун-ия, которая выполняет сравнение, игнорируя регистр

public boolean equalsIgnoreCase(String anotherString)

Пример:

String input = "Y";
if (input.equalsIgnoreCase("y")) {
    // do positive case
} else {
    // do negative case
}

String s = "AAAAA".toLowerCase();

или

String s = "а".toUpperCase();