Не передается extras через Intent

Мне нужно выполнить определенные действия в активити запущенном через Intent, но по каким то причинам информация присоединенная к интенту (в которой указано, что нужно выполнить) не передается. При запуске активити getIntent() всегда равен null. Не могу разобраться почему.

Так выглядит первый активити, из которого идет запуск второго:

public class Registration extends AppCompatActivity {
    ...
    public void clickCloseButton(View view) {
        Intent intent = new Intent(this, MainActivity.class);
        intent.putExtra("startOperation", "DialogCloseRegistration");
        startActivity(intent);
    }
    ...
}

Так выглядит второй активити, в котором нужно выполнить действия после его запуска:

public class MainActivity extends BaseActivity {
    ...
    @Override
    protected void onResume() {
        super.onResume();
        // Действие при запуске активити
        String operation = getIntent().getStringExtra("startOperation");
        if (operation != null) {
            if (operation.equals("DialogCloseRegistration")) {
                DialogFragment closeRegistration = new CloseRegistration();
                closeRegistration.show(getSupportFragmentManager(), "closeRegistration");
            }
        }
    }
    ...
}

Так выглядят настройки второго запускаемого активити в манифесте:

<activity
    android:name=".activity.MainActivity"
    android:alwaysRetainTaskState="true"
    android:exported="true"
    android:label="@string/app_name"
    android:launchMode="singleInstance"
    android:screenOrientation="portrait"
    android:windowSoftInputMode="adjustNothing">
    <intent-filter>
        <action android:name="android.intent.action.VIEW" />
        <category android:name="android.intent.category.DEFAULT" />
        <category android:name="android.intent.category.BROWSABLE" />
            <data
                android:host="site.ru"
                android:pathPrefix="/sms"
                android:scheme="http" />
    </intent-filter>
</activity>

У первого активити никаких настроек нет, кроме портретного режима.

Возможно это не важно, но MainActivity уже запускался до того как был запущен Registration.