Некорректная запись данных в файл с помощью writeInt

DataOutputStream.writeInt записывает в поток байтовое представление числа. Например, если в метод передать 10, то будут записаны четыре байта: три нулевых, а последний 00001010.

Для того чтобы число можно было прочитать в текстовом редакторе нужно, чтобы в файле были записаны символы. Например, для 10 должны быть закодированы символы «1» и «0». Сделать это можно через writeBytes, преобразовав число в строку:

 stream.writeBytes(v.getSecn().length()+"");

В параметре false - файл будет перезаписываться

public static void outputPupils(Pupil v, String path) throws IOException {
     FileWriter fout = new FileWriter(path, false);
     writer.write(v.getSecn().length());        
     writer.flush();
}

мэйн:

 String path = "ваш путь";
 Pupils.outputPupils(sb, path);