Организация тестов в многомодульном проекте

Создайте новую конфигурацию для тестовых артефактов и потом используйте ee в других модулях.

Удобно задавать конфигурацию на уровне родительского модуля, т.е. в корневом build.gradle:

configure(subprojects) {
    configurations {
        testArtifacts
    }
    task testJar (type: Jar) {
        baseName = "${project.name}-test"
        from sourceSets.test.output
    }
    artifacts {
      testArtifacts testJar
    }
}

Теперь в модуле B можно указать зависимость от testArtifacts из A:

dependencies {
   // существующие зависимости
   // предполагаем, что A находится по пути path/to/A от корня проекта
   testCompile project (path: ":path:to:A", configuration: 'testArtifacts')
}