Пройти с for по двумерному массиву

Вот так в двух циклах можно перебрать двумерный массив:

// Создаем и инициализируем двумерный массив (массив массивов)
int[][] arr = new int[3][];
arr[0] = new int[]{45, 65, 82, 12};
arr[1] = new int[]{43, 90, 44};
arr[2] = new int[]{21, 89, 22, 18, 57};
// проходим по всему массиву двумя циклами for
for (int i = 0; i < arr.length; i++) {
    for (int j = 0; j < arr[i].length; j++) {
        arr[i][j]; // здесь делаем с текущим элементом массива все, что нужно
    }
}

Или ридонли через форычи:

for (int[] ints : arr) {
    for (int anInt : ints) {
        anInt; // здесь делаем с текущим элементом массива все, что нужно (read only)
    }
}

Инициализировать массив тоже можно через такие циклы. Я здесь просто для наглядности показала, что двумерный массив может быть с разной длиной строк.