Разработать java ee приложение. С чего начать

Попробуй Spring 4 + Hibernate4. Вот в принципе простой гайд. http://www.journaldev.com/3531/spring-mvc-hibernate-mysql-integration-crud-example-tutorial

Единственный напряг будет с конфигурацией xml. Вообщем гайдов море по spring mvc + hibernate. По поводу сервиса который посылает get и post, можно реализовать обычный планировщик @Scheduled в spring. Например каждые 5 минут будет создаваться http client или просто httpconection и уже дальше в нём обрабатываешь полученные данные.

По учебникам, если время поджимает не думаю что есть время всё это переваривать. "Spring 4 для профессионалов" например

jdbc + servlets Первое для доступа к базе данных, второе для отображения на странице. Спринг и Хибернейт то дольше разбираться.