В чем принципиальные отличия Spring Cache и Hibernate Cache?

Spring Cache и Hibernate cache это просто разные абстракции для реализации кеширования.

• Spring Cache

Используется "внутри" программ для кеширования результатов вызова различных методов. Например здесь реализовано кеширование возвращаемого результата адреса для заданных значений Customer :

@CacheConfig(cacheNames={"addresses"})
public class CustomerDataService {
    @Cacheable
    public String getAddress(Customer customer) {...}

• Hibernate Cache

Это другая абстракция для реализации кеширования при обращении к БД. По умолчанию Хибернейт имеет сессионный Кеш (когда в рамках одной сессии хранятся результаты вызова запросов). Это реализовано внутренними средствами Хибернейта.

Но у него также есть возможность включить 2й уровень кеширования для сохранения возвращаемого результата из БД (для ускорения работы приложения).

Оба эти механизма предоставляют только абстракцию, а вот имплементация кеширования реализуется в других проектах, например:

• JCacheCacheManager
• EhCacheCacheManager
• CaffeineCacheManager

В Spring Cache также есть простые имплементации для реализации кеширования:

• SimpleCacheManager
• ConcurrentMapCacheManager

Но не совсем пойму - хранится ли кэш этих двух фреймворков в разных местах; и т.д

Можно для всего приложения поставить одну общую имплементацию для всех Кешей и один общий Кеш менеджер. Но физически Спринг Кеш и Кеш для Хибернейта будет лежать в разных объектах.