Github как правильно устанавливать и пользоваться пакетами

У себя закинул node в папку modules

Долго разбирал , как окончательно дефолтные пути NPM перенести в нужную мне папку,

Я не могу написать в комментах, сами понимаете). , но чтобы не было потерь и лишних работы, воспользуйтесь which npm , where node из пакета OpenServera

В финале, в хардкором случае пакеты npm, node , и сам npm придется переустанавливать с помощью yarn

А Guthub - это, в смысле, источник приложений и исходных кодов, в вашем случае? Node - сам по себе сервер. OpnServer,NPM, GitHub это как вместе в вашем вопросе связано?