Как тестировать часть кода через Mocha.js?

Попробуйте подключить файл script.js как модуль. То есть через require('./script.js') (путь указан относительно файла с тестом). Но в этом случае вы должны в файле script.js добавить в конце конструкцию module.exports = *значение*. Вместо значения будет объект содержащий функции которые вы собираетесь протестировать, например, {viewCookie: viewCookie, anotherFunction: anotherFunction} Тогда в модуле теста подключив файл с функциями, вы можете вызывать их через переменную.

var script =  require('./script.js');
var assert = require('assert');
describe('Cookies', function() {
    describe('viewCookie()', function() {
        it('should return undefined', function() {
            assert.equal(undefined, script.viewCookie());
        });
    });
});

Если вы хотите этот файл с функциями использовать в браузере, то стоит сделать проверку на наличие module.exports, так как эта конструкция свойственна для Node.js Сделать это можно следующим образом:

if (typeof module !== 'undefined' && typeof module.exports !== 'undefined') {
  module.exports = *значение*;
}