как в webpack считывать все import'ы?

Ваши конфиги(те, что вы дали) абсолютно верны.

Давайте разберемся с Вашими скриптами, а именно формулировкой jquery не работает из комментариев. Видно, наличие скриптов в бандле Вы определяли их работоспособностью. Типичный код webpack точки входа:

import "./1.js";
import "./2.js";

На выходе Вам даст что-то вроде:

(function(module, exports, __webpack_require__) {
   // 1.js
}),
(function(module, exports, __webpack_require__) {
   // 2.js
})

В этом Вы можете убедится сами, открыв бандл. Очевидно, что переменная JQuery так или иначе объявленная внутри 1.js останется видна только там. То есть, в 2.js она уже будет недоступна, с чем Вы и столкнулись.

Почему так сделано за рамками этого вопроса, поэтому попробую дать ответ на вопрос "а что же делать теперь, если я хочу jquery и что-то еще в global scope"

В случае с общедоступными библиотеками, вроде той же самой jquery удобно использовать

new webpack.ProvidePlugin({
      JQuery: 'jquery'// $: "jquery", refer to docs
})

Для такого использования jquery должна быть предварительно установлена как npm пакет.

Для самописных проектов - можно оформить их как npm пакет. Пример простого оформления(надеюсь, никого не смутит, что моего авторства): https://github.com/vpotseluyko/url-get-parser

Или же воспользоваться expose-loader

Пример:

Точка входа:

require("expose-loader?varname!./main.js");

Main.js

module.exports = 'my imp string for global scope';

Где-то в inline script:

console.log(varname); // `my imp string...'(only after webpack script loaded)

спас скринкаст . Нужно просто сделать несколько точек входа