Чтобы не повторять заголовок, немного перефразирую вопрос: каких функций jQuery следует избегать в целях избежания падения производительности?
Это только мои догадки, но я могу предположить, что медленными являются функции итерирования: $.each() и $element.each(). Что касается выборки элементов, то быстрее всего можно получить DOM по идентификатору $('#element'), а по классу, по тегу и так далее получение идёт гораздо медленнее. (Поправьте мои догадки, если что не так).
P. S. Только не надо ответов типа "jQuery - это JavaScript, так что смотрите вопросы по производительности JavaScript". Мы сейчас говорим конкретно про библиотеку jQuery, где потери в производительности могут быть вызваны выбором конкретной JavaScript-реализации, но не самого JavaScript. Но конечно, если Вы хотите заострить внимание на конкретной JavaScript-первопричине, из-за которой некоторые jQuery-методы имеют низкую производительность, что это замечательно.
Сборка персонального компьютера от Artline: умный выбор для современных пользователей