Массив с уникальными значениями

Добавляем отдельный массив, в который будем записывать хэши уже сохраненных элементов исходного массива. Новые элементы с таким же хэшем добавлять в результирующий массив не будем.
Хэш получаем с помощью JSON.stringify, но т.к. он вернет нам пустую строку для falsy-значений, то предварительно преобразуем значение в строку:

var arr = [1,2,3,3,NaN,null,false,false,undefined,2,undefined,'str','str',NaN,null, [1,2,3],[1,2,3],[3,1,2],{1:1},{1:1},{1:2}]; 
 
function u(arr) { 
  var unique=[], 
    hashes={}; 
   for(var i = 0; i < arr.length; i++) { 
    var currentHash = JSON.stringify(!!arr[i] ? arr[i] : ''+arr[i]); 
    if(!hashes[currentHash]){ 
      unique.push(arr[i]); 
      hashes[currentHash]=true; 
    } 
  } 
  return unique; 
} 
 
console.log(u(arr));

Но, как правильно заметили в комментарии, у JSON.stringify есть ограничения:

• порядок свойств в объекте может не сохраняться, т.е. может оказаться, что JSON.stringify({a:1,b:2}) = '{"b":2,"a":1}'
• мы "защищаем" хэши в исходном массиве, но во внутренних массивах/объектах JSON.stringify некоторые значения преобразует в null, что может привести к избыточному удалению элементов из исходного массива

Данных ограничений вполне достаточно, чтобы сказать, что данный метод не подходит для решения поставленной задачи, а потому не рекомендуется для использования.