Предотвратить click()

Да. такое возможно. При клике мышкой в обработчик передается объект события, у которого есть поле isTrusted

isTrusted - свойство объекта Event, доступное только на чтение. Принимает значение true, если событие было инициировано действиями пользователя, и false, если событие было создано или изменено скриптом, либо с помощью dispatchEvent.

document.getElementById('click').addEventListener('click', (e) => console.log(e.isTrusted)); 
 
document.getElementById('click').click();

#click { 
  border: 1px solid black; 
  width: 200px; 
  height: 200px; 
}

<div id="click">click me</div>