Вызов C# функции из JavaScript кода

Если я правильно понял вопрос, то вам поможет AJAX. Так как нет подробностей, то и ответ будет обобщенным - тыц

пример:

$(document).ready(function () {
$('#btnSendMessage').click(function (event) {
    event.stopPropagation();
    var data = {
        'message': $('#TextBoxSender').val(),
    }
    $.ajax({
        url: 'MessageHandler',
        type: 'POST',
        data: JSON.stringify(data),
        cache: false,
        dataType: 'json',
        processData: false,
        contentType: "application/json; charset=utf-8",
        success: function (data) {
            if (data == true) {
                alert("Сообщение доставлено");
                location.reload();
            }
            else {
                alert("Внимание! Сообщение не доставлено!");
            }
        },
        error: function () {
            alert("Произошел сбой бла бла бла");
        }
    });
});

})

Метод обработки сообщения:

[HttpPost]
public JsonResult MeesageHandler(string data)
{
    var result = "Сообщение " + data + "принято"        
    return Json(result);
}