Зачем var app = app || {} в начале пишут?

var app = app || {};

Таким образом, избегают переопределения уже инициализированного объекта, при множественной загрузке разных модулей приложения.

Эквивалент:

if (!window.app) { // Если app не определена
  window.app = {}; // Инициализируем её объектом
}

Остальные скрипты будут работать с уже определённым объектом, расширяя и дополняя его.