Я слышал, что перед переменной jQuery следует ставить $, чтобы не путать их, это так?
Ставить или не ставить, вот в чём вопрос...
Зависит от стиля писания кода.
Если кто-то считает что единый стиль нафиг не нужен, читаем это и, после обращения в веру стайл-гайдов, веруем, например, в это.
Я же думаю что лучший способ определить jQuery-объект - подсказки IDE на основе JSDoc или подобном.
Основные этапы разработки сайта для стоматологической клиники
Продвижение своими сайтами как стратегия роста и независимости