#1452 - Cannot add or update a child row: a foreign key constraint fails

Сервер ничего выдумывать не станет. Если он говорит, что в родительской таблице нет соответствующих записей - значит, их действительно нет. Выполните запрос

SELECT child.reference_field
FROM child
LEFT JOIN parent ON child.reference_field = parent.reference_field
WHERE parent.reference_field IS NULL

и смотрите, какие именно значения отсутствуют.

PS. Если у Вас child-таблица в XML - лучше импортируйте её в несвязанную временную или статическую, и потом уже смотрите, с какими записями проблемы.