Зависает mysql insert from select

Что есть:

• есть какой-то большой запрос который достает 500к записей из десятка таблиц (назвем это агригацией) и записывает все это в денормализированую таблицу. Запрос отрабатывает 10 секунд.
• mysql 5.6, настройки по умолчанию
• временная таблица (MySQL Session Table on InnoDB storage) в которую происходит запись вышеуказано запроса

Проблема:

• При запуске insert from select (выше указал) подвисает (8 часов не хватает) процесс mysql на стадии "send data"

Примечание:

• Подвисание происходит чаще всего на новой базе данных, тоесть если первый раз подвисло, если убить процесс и опять запустить то все выполниться за 40 секунд.
• Если вначале выполнить "ANALYZE TABLE ..." то процес не зависает.

Что нужно:

• хочу разобраться почему так происходит
• подскажите что можно замерять или что пременить что бы понять как правильно это исправить