foreach выводит последнею запись

Я вижу несколько проблемных мест. 1) В row (то есть в fren.txt) может быть одна записью Сделайте echo $row 2) Содержимое $baza>response->items не установлено, кроме одного раза 3) array_search постоянно возвращает FALSE, кроме одного раза

Ваше решение при прочих равных тоже должно работать, но все-таки лучше открывать/закрывать файл за циклом.

$filename = "counter.txt";
$fp = fopen($filename, "a+");
if( $fp )
{
    foreach ($row as $key => $value) {
        //...
        $test = fwrite($fp, $mytext); 
        //...
    }
    else
    {
        echo "Не могу открыть файл";
    }
    fclose($fp); 
}

Блин, код "вырви глаз". PHP7 на дворе а вы пишете как в прошлом веке. Приведу пример как бы написал я:

foreach ($row as $key => $value) {
    $baza = json_decode(file_get_contents("https://..."),true);        # Возвращает массив а не объект
    if( !@array_search($poisk, $baza['response']['items']) ) continue;  # Пропускаем шаг цикла если ничего не найдено
    file_put_contents("counter.txt", "$value \r\n", FILE_APPEND);          # Дописываем в конец файла
    echo "Good";    
}