Поиск клонов по ip

Хранить IP адреса в таком виде это не лучшие практики, почитайте ip2long

и хранить их как строку с разделителем "|" тоже не желательно. Создайте отдельную таблицу ip с полями user_id, ip и записывайте туда при каждом заходе пользователя, его id и ip соответственно, так у вас будет история посещений с разных IP и правильная структура базы данных

$str = '12.12.12.12|13.14.15.16|12.12.12.12';
$result = array_count_values(explode('|', $str));
print_r($result);

выведет:

Array ( [12.12.12.12] => 2 [13.14.15.16] => 1 )

explode - разбивает строку с помощью разделителя. В данном случае это вертикальная черта.

array_count_values - подсчитывает количество всех значений массива

Всё. Далее просто считаешь, тех, у кого значение в массиве больше 1.