Привязать домен пользователя к своему сервису

Это делается через конфиги веб сервера. Вам нужно изучить, как в http сервере, который Вы используете, реализуется подключение нескольких доменов и затем автоматизировать данный процесс и дать пользователю GUI в котором он будет указывать свой домен, что бы Ваше ПО могло сгенерировать конифг и отдать команду серверу его подхватить.

Разумеется, что у регистратора домена, который использует уже пользователь, А-запись должна смотреть на Ваш IP.

Это самая общая схема.