subquery doctrine 2

Чтобы в проверке использовать подзапросы, необходимо, чтобы подзапрос возвращал одно поле. А у вас подзапрос возвращает 3. В вашем случае придется сделать 3 разных подзапроса для movie,season,episode.

Или вообще не связываться с подзапросами, а выполнить один запрос, а во второй подставить конкретные значения movie,season,episode

Если для подзапроса используется проверка eq, то DQL подзапроса надо внести в скобки '('.$movieQuery->getDQL().')'

$movieQuery = $this->createQueryBuilder('w1')
    ->select('w1.movie')
    ->orderBy('w1.id', 'DESC')
    ->setMaxResults(1)
    ->getQuery();
$seasonQuery = $this->createQueryBuilder('w1')
    ->select('w1.season')
    ->orderBy('w1.id', 'DESC')
    ->setMaxResults(1)
    ->getQuery();
$episodeQuery = $this->createQueryBuilder('w1')
    ->select('w1.episode')
    ->orderBy('w1.id', 'DESC')
    ->setMaxResults(1)
    ->getQuery();
return $this->createQueryBuilder('w')
    ->select([
        'w.name as word',
        'w.translation as translation',
        'm.name as movie',
        'w.season as season',
        'w.episode as episode',
    ])
    ->leftJoin('w.movie', 'm')
    ->where($query->expr()->eq('m.movie', '('.$movieQuery->getDQL().')'))
    ->andWhere($query->expr()->eq('w.season', '('.$seasonQuery->getDQL().')'))
    ->where($query->expr()->eq('w.episode', '('.$episodeQuery->getDQL().')'))
    ->orderBy('RAND()')
    ->setMaxResults($limit)
    ->getQuery()
    ->getResult();

Попробуйте переписать запрос на

SELECT w.* 
FROM vocabulary.word w,
     ( select movie_id 
       from vocabulary.word  
       order by id desc LIMIT 1) sq1,
     ( select season  
       from vocabulary.word  
       order by id desc LIMIT 1) sq2,
     ( select episode  
       from vocabulary.word  
       order by id desc LIMIT 1) sq3
WHERE w.movie_id = sq1.movie_id 
  AND w.season = sq2.season 
  AND w.episode = sq3.episode 

Возможно, в такой форме будет проще.