C++ работа с файлами и папками

Чтение/запись файлов поддерживается очень давно в STL http://en.cppreference.com/w/cpp/io/basic_ifstream. Это не должно вызвать особых трудностей, а вот переименование файлов, создание каталогов и переименование каталогов, можно сделать одним из следующий способов:

1. Поддержка файловой системы (переименование файлов, создание каталогов) в STL должна быть в C++17 стандарте(http://en.cppreference.com/w/cpp/experimental/fs).
2. Также вы можете использовать boost Filesystem Library(https://www.boost.org/doc/libs/1_66_0/libs/filesystem/doc/index.htm). По сути fs C++17 основан на нём.
3. Либо использовать API операционной системы. Например для Windows: https://msdn.microsoft.com/en-us/library/windows/desktop/aa363950(v=vs.85).aspx.
4. Можно использовать сторонюю бибиотеку, например Qt также имеет функции для работы с каталоками и файлми, например QDir: http://doc.qt.io/qt-5/qdir.html

c++ до 11 стандарта точно не имел встроенных функций для работы с каталогами/папками. Есть только апи целевых платформ. То, что они "си подобны" - ничего страшного.

Сейчас появился filesystem. Его добавили в 17 стандарте, но нужно смотреть, какие компиляторы его поддерживают. (по факту - gcc только в транке - то есть, самый свежий 7.3 ещё не поддерживает, clang - даже в транке не поддерживает, 2017 студия поддерживает. Качество поддержки ещё нужно тестить).

Можно также использовать буст, в нем есть готовые обертки - https://www.boost.org/doc/libs/1_66_0/libs/filesystem/doc/index.htm

А можно не переживать, и написать свое или использовать фреймворки, тот же Qt.