Java getter для приватных объектов класса

Нужен именно обычный массив? Тогда arr.clone().

Если можно коллекцию, то на основе массива можно не модифицируемую коллекцию создать:

List<Integer> items = Collections.unmodifiableList(Arrays.stream(arr).boxed().collect(Collectors.toList()));

Или из Guava ImmutableList:

ImmutableList<Integer> values = ImmutableList.copyOf(Arrays.stream(arr).boxed().collect(Collectors.toList()));

Да, в случае объекта передается ссылка, любой объект - ссылочный тип. У вас несколько путей в этом случае: 1.Использовать клонирование объекта и передавать клон. Плюс в том, что помогает всегда. Минус в том, что вы плодите объекты. 2.Модификатор final. Плюсы в быстродействии и потокобезопасности в комплекте, никаких лишних объектов. минусы в том, что не подойдет для всех объектов, например, для массива это не поможет. Не всегда есть возможность создавать такие переменные. 3.Возможно вы передаете объекты типа Integer, Long итд. Тогда можно просто передавать примитивы, там ссылок нет и изменений никаких не сделаешь. Плюсы и минусы слону понятны.