Конвертация двумерного массива в ArrayList

Метод Arrays.asList(T... a) принимает параметр вида T... a, что означает массив объектов типа T. Ошибка в том, что вы в голове подразумеваете под типом T в данном случае тип int, но int - это примитив, и он не может быть дженериком. Поэтому в качестве T понимается объект типа int[]

В итоге в вашем list лежит 2 элемента с типом int[], выглядит это так:

1: [1,2]

2: [3,4]

Для исправления предлагаю 2 способа:

1. Заменить примитивный тип int на Integer

   System.out.println("Массив: " + toList(new Integer[][]{{1, 2}, {3, 4}}) 
   //........
   //........
   public List<Integer> toList (Integer[][] array) {
       List list = new ArrayList();
       for (Integer[] i : array) {
           list.addAll(Arrays.asList(i));
       }
       return list;
   } 
   

2. Разворачивать внутренний массив руками

   public List<Integer> toList (int[][] array) {
       List list = new ArrayList();
       for (int[] i : array) {
           for(int j : i){
               list.add(j);
           }
       }
       return list;
   }
   

Да, собственно, если бы вы объявили переменную List list правильно, как List<Integer> list, то ваш код даже не скомпилировался бы, в вашем же случае есть всего лишь warning, на который стоило бы обратить внимание.