Отличия свойства от переменной

В JavaScript все глобальные переменные и функции являются свойствами специального объекта, который называется «глобальный объект» (global object). В браузере этот объект явно доступен под именем window. Объект window одновременно является глобальным объектом и содержит ряд свойств и методов для работы с окном браузера.

Присваивая или читая глобальную переменную, мы, фактически, работаем со свойствами window, например:

var a = 5; // объявление var создаёт свойство window.a
alert(window.a); // 5

Создать переменную можно и явным присваиванием в window:

window.a = 5;
alert(a); // 5

Соответственно, отличий особо нет. Ну, кроме того, что к переменной еще можно обратиться просто по имени. Ссылка для ознакомления: Глобальный объект Глобальные переменные на самом деле являются свойствами объекта window - значит это одно и то же.