Скажите правильно я понял функцию copy

Получается dst[key] тоже получает значение ?

да, получает

В js есть гораздо более прогрессивные способы копировать объекты

Object.assign() https://developer.mozilla.org/ru/docs/Web/JavaScript/Reference/Global_Objects/Object/assign

Spread оператор https://developer.mozilla.org/ru/docs/Web/JavaScript/Reference/Operators/Spread_syntax

Ну вы добавьте return dst в copy,

увидите что она добавляет в первый объект значения из второго и третьего

var vasya = { 
  age: 21, 
  name: 'Вася', 
  surname: 'Петров' 
}; 
 
var user = { 
  isAdmin: false, 
  isEmailConfirmed: true 
}; 
 
var student = { 
  university: 'My university' 
}; 
 
function copy() { 
  var dst = arguments[0]; 
 
  for (var i = 1; i < arguments.length; i++) { 
    var arg = arguments[i]; 
    for (var key in arg) { 
      dst[key] = arg[key]; 
    } 
  } 
   return dst 
} 
 
console.log(copy(vasya, user, student));

{
    "age": 21,
    "name": "Вася",
    "surname": "Петров",
    "isAdmin": false,
    "isEmailConfirmed": true,
    "university": "My university"
}