Как сделать правильно запрос к таблице?

SELECT product_id 
FROM product_attribute 
WHERE attribute_id IN (12, 17)
GROUP BY product_id 
HAVING COUNT(DISTINCT attribute_id) = 2

можете расписать схему работы ?

Выделяем (WHERE) записи с заданными значениями attribute_id. Считаем, сколько разных (DISTNCT) attribute_id выделено для каждого product_id (GROUP BY). Оставляем только те product_id (HAVING), для которых посчитанное количество равно количеству разных attribute_id в списке (т.е. для которых присутствует хотя бы по одному разу каждый заданный attribute_id).

SELECT
    pa.product_id
FROM
    product_attribute pa
INNER JOIN
(
    SELECT
        product_id
        ,COUNT(*) Num
    FROM
        product_attribute
    GROUP BY
        product_id
) T ON T.product_id = pa.product_id
WHERE
    attribute_id IN (12, 17)
GROUP BY
    pa.product_id
HAVING
    COUNT(*) = MAX(T.Num)