Как передать параметры в php файл из bash

Если ваш скрипт запуска выглядит, как-то так:

#!/bin/sh
php index.php -pvalue qwe

то перечень передаваемых параметров в вызываемом скрипте вы можете получить, используя $argv. В данном случае это будут

0 => index.php
1 => -pvalue
2 => qwe

Для получения значений параметров можете использовать getopt(). Например, getopt("p") вернет значение value. Значения можно писать слитно, через пробел и знак равенства. Обязательные и не обязательны параметры обозначаются через : или :: и так далее согласно документации.

Ответ в документации http://php.net/manual/ru/reserved.variables.argv.php

Первый пример - ответ на Ваш вопрос