Как узнать из какой строки и какого файла был вызван метод класса?

Если вообще не хочется попу отрывать от стула, то

debug_backtrace()

спасет мир. Предупреждаю: крайне тяжелая функция для повседневного использования в релизе.

UPD:

есть альтернатива?

Конечно.

1. делаем логирование. Внутри вызова каждой функции, в самом начале константы METHOD и FILE отправляем в какой-нибудь глобальный массив, либо в свойство класса логирования. Потом можно извлечь и посмотреть что за чем было вызвано.
2. использовать продвинутую IDE. Про них уже на этом сайте исписано множество тем. Выбирайте любую.
3. если вы мазохист, можно вручную отследить весь путь развития программы.

Согласен с knes`ом

echo bugs(print_r(debug_backtrace(), true));
// bugs - название вашей функции или метода

все покажет