Как восстановить приложение?

Наиболее частой причиной ошибки 500 (Internal Server Error, внутренняя ошибка сервера) является неверный синтаксис файла .htaccess или наличие в нем неподдерживаемых директив. Чаще всего достаточно закомментировать директиву Options (для этого нужно поставить в начале строки решетку — #), и проблема исчезнет.

Ошибка 500 также может возникать вследствие неправильного обращения с CGI-скриптами:

CGI-скрипты должны иметь окончания строк в формате UNIX (\n), а не в формате Windows (\r\n). Для этого их надо загружать на сервер по FTP в режиме ASCII.

CGI-скрипты и папки, в которых они находятся, должны быть доступны для записи только владельцу, то есть иметь права 0755 (drwxr-xr-x).

В результате работы CGI-скрипта сформированы неправильные HTTP-заголовки ответа. В этом случае для решения проблемы полезно обратиться к error_log (его можно найти в контрольной панели в разделе «Хостинг / Статистика / Лог-файлы / Ошибки»).

Решил проблему следующим образом:

1. Удалил папку проекта.

2. С помощью composer установил чистый проект yii2-advanced

3. Сделал git fetch --all внутри папки чистого проекта

4. Сделал git reset --hard origin/master

5. Сделал git pull origin dev

6. Заново настроил подключение к базе данных (не знаю почему сбилось)

7. Создал заново ветку dev

8. Заново настроил права chmod

После этого проект снова прекрасно работает.