Android storage access framework

Как вам правильно сказали в комментариях, не все Uri являются файлами, это может быть например ссылка в сети или вообще запись в БД.

А раз так, то вам нужно правильно определять какие Uri являются файлами, например так:

/**
 * @return Whether the Uri authority is file.
 */
public static boolean isFileDocument(final Uri uri) {
    if(uri.toString().startsWith("file://"))
        return true;
    return false;
}
/**
 * @return Whether the Uri authority is ExternalStorageProvider.
 */
public static boolean isExternalStorageDocument(final Uri uri) {
    return "com.android.externalstorage.documents".equals(uri.getAuthority());
}
/**
 * @return Whether the Uri authority is DownloadsProvider.
 */
public static boolean isDownloadsDocument(final Uri uri) {
    return "com.android.providers.downloads.documents".equals(uri.getAuthority());
}
/**
 * @return Whether the Uri authority is MediaProvider.
 */
public static boolean isMediaDocument(final Uri uri) {
    return "com.android.providers.media.documents".equals(uri.getAuthority());
}

По хорошему, если Uri являюется одним из указанных типов, то его можно сконвертировать в некое подобие файла. Если нет, скажем это запись в БД в виде BLOB'а то может подойти вариант:

 context.getContentResolver().openFile(uri, mode);

Если не получается, то на помощь для чтения придет:

InputStream is=context.getContentResolver().openInputStream(uri);

Для записи: context.getContentResolver().openOutputStream(uri);