Thread порядок выполнения

 final ProgressDialog dialog;
            /**
             * Progress Dialog for User Interaction
             */
            dialog = new ProgressDialog(getActivity());
            Thread myThread = new Thread( // создаём новый поток
                                    new Runnable() { // описываем объект Runnable в конструкторе
                                        public void run() {
                                            generateClan_Dannie(hashMap, clan_id);// вызываем метод воспроизведения
                                        }
                                    }
                            );

                            myThread.start();
                            try {
                               myThread.join(); //та строка, что заставит ждать поток.
                            } catch (InterruptedException e) {
                                e.printStackTrace();
                            }
                            Intent intent;
                            intent = new Intent(getActivity(), MainActivityClan.class);
                            startActivity(intent);
                            dialog.dismiss();
                            getActivity().finish();/

Но вообще, в android не рекомендуется вызывать сырые потоки, используйте лучше AsyncTask \ runOnUiThread или Сервисы